文献电子报: iScience福建农林许卫锋:NMT发现碱胁迫促突变体根泌H+ 为N-糖基化影响IAA合成运输提供间接证据 内容:
基本信息
主题:NMT发现碱胁迫促突变体根泌H+ 为N-糖基化影响IAA合成运输提供间接证据
期刊:iScience
研究使用平台:NMT植物耐盐创新平台
标题:MNSs-mediated N-glycan processing is essential for auxin homeostasis in Arabidopsis roots during alkaline response
作者:福建农林大学许卫锋、夏天雨
检测离子/分子指标
H+
检测样品
拟南芥根伸长区(距离根尖520~850 μm根表上的点)
中文摘要
内质网(ER)内腔和顺式高尔基体的早期步骤包括Ⅰ类α-甘露糖苷酶(MNSs)对N-聚糖的修调,它们在根系生长和胁迫响应中起关键作用。本研究发现mns1 mns2 mns3突变体中的根系生长抑制在碱性条件下得到了部分修复,而阻断生长素运输的抑制剂处理抵消了这种碱性条件维持的根系生长。进一步研究发现,在mns1 mns2 mns3中,吲哚-3-乙酸(IAA)在正常条件下检测不到,而在碱性条件下恢复到正常水平,证实了N-糖肽谱结果,其中N-糖肽与IAA的生物合成、氨基酸结合物的水解有关,响应结果显示mns1 mns2 mns3在正常和碱性条件下具有不同的丰度。总之,本结果表明,在对碱性胁迫的响应中,拟南芥内质网和顺式高尔基体中MNSs介导的N-聚糖加工,与维持生长素的稳态和运输有关。
离子/分子流实验处理方法
在pH 6.0或pH 8.2的培养基生长10 d
离子/分子流实验结果
有研究表明,植物根系中的质子流速在维持根系生长和促进植物对包括碱性胁迫在内的多种胁迫的响应中起着至关重要的作用。为了研究碱性pH是否可能恢复mns1 mns2 mns3突变体的根系生长,研究采用非损伤微测技术(NMT)测量了净质子流速。研究发现,10日龄WT主根伸长区的质子外排,在正常条件下和碱性pH条件下没有显著差异;相比之下,mns1 mns2 ...
文献电子报: MP山师王宝山:在体单细胞盐腺泌Na+检测技术 NMT为盐生植物抗盐适应演化机制提供证据 内容:
基本信息
主题:在体单细胞盐腺泌Na+检测技术 NMT为盐生植物抗盐适应演化机制提供证据
期刊:Molecular Plant
影响因子:13.164
研究使用平台:NMT植物耐盐创新平台
标题:The genome of the recretohalophyte Limonium bicolor provides insights into salt gland development and salinity adaptation during terrestrial evolution
作者:山东师范大学王宝山、陈敏、袁芳、王茜、赵博庆、徐晓静、北京贝瑞和康生物技术有限公司史淼
检测离子/分子指标
Na+
检测样品
二色补血草盐腺
中文摘要
盐生植物会进化出专门应对高盐度的方式。极端盐生植物二色补血草(Limonium bicolor)表皮缺乏毛状体,但有盐腺,可排出钠等有害离子,避免盐害。本文利用Illumina短序列、单分子实时长序列、染色体构象捕获(Hi-C)数据和Bionano基因组图谱,报道了一个高质量、2.92Gb染色体规格的二色补血草基因组组装,极大地丰富了具有多细胞盐腺的泌盐盐生植物的基因组信息。虽然二色补血草基因组具有与拟南芥(Arabidopsis thaliana)毛状体命运基因相似的基因,但其与命运决定基因GLABRA3、ENHANCER of GLABRA3、GLABRA2、TRANSPARENT TESTA GLABRA2和SIAMESE缺乏同源性,为该物种缺乏毛状体提供了分子解释。在毛状体经典同源基因中,发现了控制盐腺发育的关键基因LbHLH和LbTTG1的突变显著破坏了盐腺的启动、盐的分泌和盐的耐受性。这为长期存在的盐腺和毛状体可能有共同起源的假设提供了基因支持。此外,二色补血草在与苦荞麦分化后发生了全基因组复制事件,这可能是苦荞适应高盐环境的原因之一。二色补血草的基因组资源为植物耐盐机制的研究提供了丰富的信息,有助于耐盐作物的工程化。
离子/分子流实验处理方法
WT、Mock-CR、Mock-OE、Lbttg1-cr、Lbhlh-cr、LbTTG1-OE、LbHLH-OE株系
离子/分子流实验结果
本研究其他结果表明,LbTTG1和LbHLH参与盐腺的发育,影响盐腺密度和外观。此外,CR和OE株系的作用方向表明这两种蛋白在盐腺发育中起到负作用。为了确定OE和CR株系中观察到的异常盐腺(或大或小)是否仍具有功能,研究使用非损伤微测技术(non-invasive ...
文献电子报: Sci Total Environ:抑制钾信号影响地杆菌生物膜的形成 | NMT生物膜创新科研平台 内容:
研究使用平台:NMT生物膜创新科研平台
期刊:Science of the Total Environment
主题:抑制钾信号影响地杆菌生物膜的形成
标题:Potassium channel blocker inhibits the formation and electroactivity of Geobacter biofilm
影响因子:5.589
检测指标:K+流速
检测样品:地杆菌
K+流实验处理方法:
地杆菌分别在0mM、5mM、10mM的TEA中处理
K+流实验测试液成份:0.1mM KCl、1mM glucose
作者:福建农林大学陈姗姗、靖宪月
中文摘要(谷歌机翻)
生物膜中的细菌能够利用钾离子通道介导的电信号来实现细胞间的通信。然而,目前尚不清楚当被强电场包围时,这些信号是否在Geobacter sp。中起作用。
这项研究使用了钾通道阻滞剂(四乙铵,TEA),该阻滞剂干扰K+的释放,但不干扰细菌的生长,以证明钾离子通道介导的电信号传导影响了Geobacter sulfreducens的形成和电活性。结果表明,5 mM TEA减慢了地球还原硫细菌生物膜的形成,电流密度比对照组低约50%。
电化学分析表明,加入TEA的生物膜的电活性较差。特别是,具有TEA的微米级生物膜表现出较少的高电流峰,并且参与还原性减少硫杆菌的生物膜中电子转移的最外层基团的物种与对照组不同。
这项工作提供了初步的证据来揭示钾通道在还原性土壤杆菌中的电活性生物膜的作用。
Mean net K+ fluxmeasured from ...
中关村NMT产业联盟: NMT科研应用的文献资料 内容:
1、NMT在盐碱胁迫上的应用案例
1)国内应用概况
经联盟统计,国内非损伤微测技术在盐胁迫上的应用成果,是植物科学领域占比第一的方向,目前的应用比较成熟,但也有诸多空白,例如Na+在根内、地上部分的动态转运,液泡区隔Na+等等,非损伤微测技术几乎没有相关成果发表。
非损伤微测技术在盐生植物的应用,国内主要有三大非损伤微测技术实验室在做,分别是山东师范大学王宝山教授团队、厦门大学郑海雷教授团队、内蒙古大学王迎春教授团队。2022年5月,Molecular Plant报道了王宝山教授团队关于盐生植物抗盐适应演化机制的最新研究成果。该研究使用了非损伤微测技术,实现了在体单细胞盐腺泌Na+速率检测,为该研究提供了关键的生理证据。
2)文献成果
http://nmtia.org.cn/NMTyxp
3)NMT在盐碱胁迫上的应用思路课程(微信扫码)
2、NMT在水旱胁迫上的应用案例
1)国内应用概况
非损伤微测技术在水旱胁迫上的应用,主要集中在干旱胁迫下的根系发育、气孔调节、活性氧运输。还包括干旱胁迫下养分元素的吸收。涉及到的研究团队有福建农林大学许卫锋教授团队、浙江大学张国平教授团队、安徽农业大学宛晓春教授团队、西北农林科技大学李积胜教授团队、长江大学吴强盛团队等。其中,2018年,中科院西北生态环境资源研究所石玉兰博士在Journal of Experimental Botany发表的Integrated regulation triggered by a cryophyte ω-3 desaturase gene confers multiple-stress tolerance in tobacco成果中,利用非损伤微测技术检测了盐胁迫、渗透胁迫下,烟草根的Ca2+跨膜转运信号,为该研究提供了关键数据证据。
2)文献成果
http://nmtia.org.cn/NMTshxp
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文献电子报: PP :林金星IAA流成果丨NRT1.1磷酸化调节侧根发育的机制(附NMT实验体系) 内容:
期刊:Plant Physiology
主题:NRT1.1磷酸化调节侧根发育的机制
标题:Phosphorylation-mediated dynamics of nitrate transceptor NRT1.1 regulate auxin flux and nitrate signaling in lateral root growth
影响因子:6.305
检测指标:IAA流速
检测部位:酵母细胞
IAA流速流实验处理方法:转化酵母细胞在SD-URA培养基长到对数期,转至SG-URA培养基[SD-URA培养基中的dextrose替换为2%(m/v)galactose]上,培养24-48小时,诱导NRT1.1,T101A,T101D,mRuby表达。离心收集并制成SG-URA悬液。
IAA流速流实验测试液成份:0.5 μM IAA, 2% (m/v) galactose, 0.3 mM MES, ...
文献电子报: Chemosphere:TiO2提升黄孢原毛平革菌镉耐受力的生理证据 内容:
2014年12月24日,湖南大学曾光明、陈桂秋、谭琼用NMT在Chemosphere上发表了标题为Physiological fluxes and antioxidative enzymes activities of immobilized Phanerochaete chrysosporium loaded with TiO2 nanoparticles after exposure to toxic pollutants in solution的研究成果。
期刊:Chemosphere
主题:TiO2提升黄孢原毛平革菌镉耐受力的生理证据
标题:Physiological fluxes and antioxidative enzymes ...
文献电子报: Nature Climate Change叶乃好:NMT钙流为气候变化导致冰藻运动能力下降提供信号调节证据 内容:
研究使用平台:NMT微藻创新科研平台
期刊:Nature Climate Change
主题:NMT钙流为气候变化导致冰藻运动能力下降提供信号调节证据
标题:Decreased motility of flagellated microalgae long-term acclimated to CO2-induced acidified waters
影响因子:21.72
检测指标:Ca2+流速
检测样品:极地冰藻
Ca2+流实验处理方法:极地冰藻在280、400、700、1,000、1,500和2,000 ppm的CO2浓度环境下,传代培养5年
Ca2+流实验测试液成份:0.2 mM CaCl2, 360 mM NaCl, 2.0 mM NaHCO3, 8.0 mM KCl, ...
文献电子报: Plant Cell Physiol:Ca2+流指示的微藻氮胁迫信号转导研究 内容:
2014年01月14日,中科院水生所王强、陈辉用NMT在Plant and Cell Physiology上发表了标题为Ca2+ Signal Transduction Related to Neutral Lipid Synthesis in an Oil-Producing Green Alga Chlorella sp. C2的研究成果。
期刊:Plant and Cell Physiology
主题:Ca2+流指示的微藻氮胁迫信号转导研究
标题:Ca2+ Signal Transduction Related to ...
文献电子报: Environ Pollut:NMT验证稻田生物膜大量吸附Cd降低水稻Cd积累 | NMT重金属创新科研平台 内容:
研究使用平台:NMT重金属创新科研平台
期刊:Environmental Pollution
主题:NMT验证稻田生物膜大量吸附Cd降低水稻Cd积累
标题:Paddy periphyton reduced cadmium accumulation in rice (Oryza sativa) by removing and immobilizing cadmium from the water–soil interface
影响因子:5.714
检测指标:Cd2+流速
检测样品:水稻附生植物
Cd2+流实验处理方法:水稻幼苗在Cd0+P(附生植物),Cd5(5mg Kg-1的土壤Cd含量)+P和Cd50(50mg Kg-1的土壤Cd含量)+P处理60天后,取水稻附生植物进行测试。
Cd2+流实验测试液成份:50 μM CdCl2, 0.1 mM ...
文献电子报: ECOTOX ENVIRON SAFE :中国海大丨Ca2+流可作为防污涂料性能评价指标 内容:
期刊:ecotoxicology and environmental safety
主题:Ca2+流可作为防污涂料性能评价指标
标题:Synthesis and antifouling evaluation of indole derivatives
影响因子:4.527
检测指标: Ca2+流速
检测部位:藻细胞
Ca2+流实验处理方法:亚心形扁藻,吲哚衍生物瞬时处理
Ca2+流实验测试液成份:0.1mM KCl, 0.1mM CaCl2, 0.1mM MgCl2, 0.5mM NaCl, 0.3mM MES,0.2mM Na2SO4 and 0.1% sucrose, pH ...
文献电子报: Chemosphere :深圳大学丨盐度调控的海洋硅藻细胞表面镉离子流 内容:
期刊:Chemosphere
主题:盐度调控的海洋硅藻细胞表面镉离子流
标题:Salinity-dependent nanostructures and composition of cell surface and its relation to Cd toxicity in an estuarine diatom
影响因子:4.427
检测指标:Cd2+流速
检测部位:硅藻藻细胞
Cd2+流速流实验处理方法:不同盐度的硅藻细胞
Cd2+流速流实验测试液成份:0.1mM KCl,0.1mM MgCl2, 0.5mM NaCl, 0.3mM 2-(N-morpholino) ethanesulfonic acid ...
文献电子报: J Hazard Mater:NMT为硅处理提升藻类耐Cd能力提供直接证据 | NMT重金属创新科研平台 内容:
研究使用平台:NMT重金属创新科研平台
期刊:Journal of Hazardous Materials
主题:NMT为硅处理提升藻类耐Cd能力提供直接证据
标题:The roles of silicon in combating cadmium challenge in the Marine diatom Phaeodactylum tricornutum
影响因子:7.65
检测指标:Cd2+流速
检测样品:硅藻
Cd2+流实验处理方法:硅藻细胞分别在低硅(17.2μM),中硅(51.7μM),高硅(86.2μM)培养
Cd2+流实验测试液成份:8.9μM CdCl2,0.1mM KCl, 0.1mM MgCl2,0.5mM NaCl, 0.3mM MES, 0.2mM ...
文献电子报: FEMS MICROBIOL LETT :菌丝发育过程中的氧流速图谱 内容:
文章标题:Oxygen flux magnitude and location along growing hyphae of Neurospora crassa
菌丝发育的机制比较复杂,而真菌菌丝由于形态结构清晰,为菌丝发育研究提供了良好的材料。Ca2+离子流形成的离子梯度在菌丝发育过程中起重要的调控作用。粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的一个显著特征是在菌丝尖端含有丰富的线粒体,为菌丝发育提供ATP。
为了研究菌丝尖端线粒体的呼吸活性,就需要一种高空间分辨率的氧流速测定方法。加拿大研究人员Roger R. Lew以粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)为实验材料,运用非损伤微测技术结合显微技术研究了氰化物等处理后菌丝表面不同区域的氧流速变化。发现菌丝表面的氧内流(吸收)速率可被氰化物抑制,而交替氧化酶则可以恢复呼吸作用。菌丝尖端靠后10μm有个氧内流速率很大的区域,且氧内流的速率与菌丝的生长速率相关,而线粒体在菌丝体上富集的区域在距离尖端5~10μm处,与最大氧内流区域不同。因此,菌丝尖端的线粒体在生长发育的呼吸需求中所起的作用较小。
基于上述结果,他们认为尖端富集的线粒体可能在清除胞质Ca2+方面起作用,推测菌丝尖端可能是线粒体的发生部位。
图注:菌丝生长速率与氧气内流的关系;菌丝显微图及菌丝不同区域氧流速图。
参考文献:Lew, R. R. and Levina, N. N. FEMS Microbiology Letters, 2004, ...
文献电子报: New Phytol:质子流可作为丛枝菌根真菌芽管菌丝发育的标签丨NMT创新平台成果回顾 内容:
文章标题:A pH signaling mechanism involved in the spatial distribution of calcium and anion fluxes in ectomycorrhizal roots
菌根化是一种典型的宿主植物-真菌共生互作,尽管有大量的解剖学及生理学研究清楚地表明真菌菌根可以增大宿主植物根部吸收面积、合成并向土壤释放有机化合物及菌体外酶以固定营养成分、调控宿主植物根部参与跨膜营养物质转运的蛋白,但其具体机制,目前尚不清楚。
NewPhytologist报道了葡萄牙研究人员Feijó等利用非损伤微测技术研究离子流在菌根生长过程中作用的成果。他们检测了豆马勃属真菌(ECM)侵染后及未经侵染处理的桉树根部H+、Ca2+及阴离子A-(以Cl-代替)的离子流。
同时,他们利用特异性抑制剂矾酸盐、钆及4,4-二异硫氰2,2-二磺酸芪(DIDS)分别抑制质子泵、钙离子通道、氯离子转运通道,并再次分别检测了上述三种离子流。
结果发现,真菌侵染主要作用于根部伸长区,离子运动及根围酸化能力都发生了剧烈变化,而且离子流变化呈现周期性变化。连续波长光谱分析表明,ECM根部H+及A-离子流的变化周期较未经侵染的长,而ECM根部的Ca2+振荡则完全消失。
根据上述结果,Feijó等通过构建模型解释植物养分吸收及生长加速是通过侵染真菌介导,依赖pH的变化,而且ECM营养的主要供应是植物的根,发现Ca2+在这一过程中发挥了重要的作用,这为揭开植物-真菌共生互作提供了证据和模型。
图注:对照及真菌侵染后桉树根部伸长区离子流的振荡变化图以及真菌侵染后根部的pH信号机制模型。
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文献电子报: New Phytol:质子流可作为真菌菌丝发育的标签 | NMT创新平台成果回顾 内容:
文章标题:Blackwell Publishing Ltd Proton (H+) flux signature for the presymbiotic development of the arbuscular mycorrhizal fungi
2008年4月,葡萄牙里斯本大学Feijó等科学家使用非损伤微测技术研究了芽管菌丝发育时期菌丝中的H+流,发现胞外的pH在宿主和真菌间的离子交换和AM真菌生长中起到重要作用,菌丝的H+流振荡与芽管菌丝的生长存在相互关系,AM菌丝的H+流和生长被宿主根系分泌物(RE)所调控。菌丝H+流空间和时间的转变被营养利用状况所调控,也有可能被pH信号所诱导。
此项工作对于认识真菌的生长发育以及响应外源物质的机理提供了全新的思路,也揭示了菌丝对P和Suc利用的细胞生物学生理学机制。
图注:AM真菌发育的H+流标签。
Stage1:单一萌发管期菌丝中H+保持稳定的内流;
Stage2:真菌差别的最大状态(5-7d),菌丝分枝后H+流发生改变。
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